本部長:関西経済連合会会長 松本正義
本部は、構成機関等の代表者により構成され、戦略に関する意志決定を行います。
座長:京都大学名誉教授・特任教授 小林潔司
幹事会は、構成機関の実務担当部門の代表者などにより構成され、戦略に関する議論を行います。電子メール等を活用したバーチャルな幹事会も駆使し、機動的な運営を行います。
関西経済連合会と国土交通省(近畿地方整備局、近畿運輸局、大阪航空局)が協力して事務局を務めます。また、ホームページの設置管理、国際物流目安箱に投函される情報の管理、意見整理等についても事務局が行います。